La Secretaría General y la SUAyED-FM, en conjunto con la Secretaría de Servicios Escolares, son las áreas encargadas de gestionar y coordinar la impartición y programación de las asignaturas optativas de la Licenciatura de Médico Cirujano.

Las asignaturas optativas pueden abordar contenidos complementarios a las obligatorias; ya que poseen mayor nivel de especificidad de un tema o tienen contenidos que son producto de investigaciones muy recientes y no necesariamente se encuentran en las obligatorias. Es así que las optativas, cuentan con temas a profundidad, innovadores y a la vanguardia en la ciencia médica, socio-médica y humanística, que contribuyen a la formación integral del médico cirujano.